Mikroszkóppal azonosítható meghatározott szervezetek
A szabadon élő szervezetek többsége nem patogén, az emberi egészséget nem veszélyeztetik, ámbár a kórokozó vírusok, baktériumok és protozoák terjesztésében, fertőtlenítőszerrel szembeni védelmében, ezáltal a vízhálózatban tartásukban és terjesztésükben nagymértékben szerepet játszanak. Az ivóvízben vizsgálandó szervezetek vízhigiénés indikátorok, de a protozoák (véglények) és a férgek között lehetnek kórokozók is. A szennyezés eredete a nyersvíz (kút/vízbázis elszennyeződése), a technológia (biológiai ammóniummentesítés, homokszűrők különösen, ha levegőztetés, gáztalanítási lépés is van), hálózat (csőtörés, műszaki problémák, biofilm) is lehet. A mikroszkópos biológiai szennyezés esetén mindenképpen törekedni kell a kifogásoltsághoz vezető okok felderítésére és a probléma forrásánál történő kezelésére.
algák: az algák jelenléte a vízben több mindenre utalhat. Az algák jelenléte utalhat arra, hogy valahonnan a csőhálozaton kívülről történő felszíni vízszivárgás került a vízvezeték rendszerbe. A víz valahol pang és fény éri.
cianobaktériumok: a cianobaktérumok jelenléte a vízben több mindenre utalhat. Az cianobaktérumok jelenléte utalhat arra, hogy valahonnan a csőhálozaton kívülről történő vízszivárgás került a vízvezeték rendszerbe. A víz valahol pang és fény éri.
házas amőbák: Homokszemekből vagy fehérjéből, vagy a vízben oldott kovasavból előállított lemezekből jellemző formájú egynyílású vázakat készítenek maguknak.
egyéb véglények (protozoák):
A csillósok vagy ázalékállatok (Ciliophora) a Protozoa egy csoportja, amelyek fő jellemzője a testüket egészen vagy részben borító hajszerű képletek, a csillók, melyek az ostorhoz hasonló felépítésük, de annál rövidebbek és nagyobb számban találhatók meg egy egyeden és eltérő hullámzó mintázatot alkotnak. Csillókkal a csoport minden tagja rendelkezik és számos életfolyamathoz: úszás, mászás, rögzülés, táplálkozás, érzékelés használják.
A csillósok a protiszták egyik legfontosabb csoportja, szinte bárhol előfordulnak, ahol víz van jelen. Megtalálhatók tavakban, pocsolyákban, óceánokban, folyókban, talajban. A csoportnak számos ektoszimbióta és endoszimbióta tagja van, de megtalálhatók benne obligát és opportunista paraziták is. A csillósok egysejtűek, néhány fajuk elérheti a 2 mm-es hosszot, némelyikük felépítésben a legösszetettebb protozoák közé tartozik.
gombák: A gombák vagy gomba-spórák bekerülhetnek a vízhállózatba ha gombák előfordulását érzékeljük szükséges a hálózat fertőtlenítése. És a probléma megismétlődésének megelőzése.
férgek: a férgek azon belül is a fonalférgek előfordulhatnak a vízvezeték rendszerekben, amenyniben ilyet tapasztalunk ne fogyasszunk a vízből hanem fertőtlenítsük a hálózatot és gondoskodjunk rólla, hogy a fertőzés ne tudjon megismétlődni.
A település vízminősége Mikroszkópos biológiai paraméterek tekintetében „kifogásolt” minőségű, ha a vízellátó rendszerben vett vízminták legalább 30%-ában valamely Mikroszkópos biológiai paraméter meghaladja a parametrikus értéket.